127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3993 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  90.73 
 
 		 550 aa  1041    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 550 aa  1140    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  41.05 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2840  tetratricopeptide TPR_4  35.37 
 
 		 420 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  25.63 
 
 		 397 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 689 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.07 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  25.82 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 690 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 		 1979 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.84 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.84 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 4489 aa  57.8  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.86 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 597 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 685 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 878 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.11 
 
 		 632 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.51 
 
 		 795 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 591 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  26.26 
 
 		 325 aa  53.5  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  25.12 
 
 		 329 aa  53.5  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.51 
 
 		 732 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 313 aa  53.5  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  28.49 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.72 
 
 		 810 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  22.3 
 
 		 329 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 4079 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 808 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  24.1 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 543 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  27.65 
 
 		 370 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.68 
 
 		 816 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 355 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.1 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 448 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.93 
 
 		 865 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 620 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.19 
 
 		 620 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 3035 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1276 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 362 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  26.47 
 
 		 420 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.06 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 892 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 968 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.46 
 
 		 707 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  23.43 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 3560 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.43 
 
 		 622 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.43 
 
 		 623 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 714 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 750 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  26.55 
 
 		 338 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 739 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 377 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 1450 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1138 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 		 1694 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  31.58 
 
 		 703 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.5 
 
 		 545 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0993  putative lipoprotein  27.5 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0358933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 221 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 767 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.53 
 
 		 730 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.97 
 
 		 676 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 371 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 909 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 363 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.74 
 
 		 884 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.43 
 
 		 764 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 761 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1085 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 615 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 205 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 363 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  27.2 
 
 		 247 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 689 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 638 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 648 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.41 
 
 		 377 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  26.52 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 		 297 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>