27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3884 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  869    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  30.15 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.56 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  23.9 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  21.22 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.63 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  26.96 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  22.22 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.17 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5003  hypothetical protein  22.46 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.403885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  22.6 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01309  hypothetical protein  23.05 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.127385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  22.53 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  26.79 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  26.47 
 
 		 550 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  28.12 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.28 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  20.12 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  23.05 
 
 		 329 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  28.29 
 
 		 329 aa  47  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  24.55 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  24.12 
 
 		 380 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>