42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5827 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  100 
 
 		 397 aa  797    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  30.7 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  30.47 
 
 		 378 aa  113  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  26.93 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  24.85 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5003  hypothetical protein  25.35 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.403885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.59 
 
 		 393 aa  97.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  25.63 
 
 		 550 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.29 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.29 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  24.84 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  35.71 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  24.72 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.47 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.74 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1625  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  23.71 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01309  hypothetical protein  25.86 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.127385  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  27.62 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  22.22 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  21.24 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 689 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  27.78 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  25.15 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 690 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.26 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  27.27 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  25.81 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  27.37 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  22.12 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  26.32 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  30.65 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.31 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 690 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.18 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  22.26 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  23.08 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  24.31 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>