17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2913 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2517  hypothetical protein  54.55 
 
 
313 aa  351  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  44.52 
 
 
332 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0114  hypothetical protein  43.75 
 
 
306 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1499  hypothetical protein  39.92 
 
 
310 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.488999  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2697  hypothetical protein  22.59 
 
 
378 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.644879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  25.77 
 
 
448 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  24.69 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  24.69 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  23.91 
 
 
369 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.41 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.57 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0113  hypothetical protein  30.1 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1386  hypothetical protein  23.91 
 
 
402 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  24.31 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.16 
 
 
393 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.16 
 
 
393 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>