16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2539 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  674    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0114  hypothetical protein  48.37 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  44.52 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2517  hypothetical protein  43.79 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1499  hypothetical protein  40.07 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.488999  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  31.1 
 
 		 448 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1386  hypothetical protein  29.19 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0113  hypothetical protein  34.96 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2697  hypothetical protein  25.23 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.644879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  26.67 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.68 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  29.28 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.06 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.06 
 
 		 393 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2413  cellulose biosynthesis protein CelD  28.38 
 
 		 359 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.92081  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  23.19 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>