14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1499 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1499  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.488999  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2517  hypothetical protein  39.29 
 
 
313 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  37.17 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  40.98 
 
 
332 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0114  hypothetical protein  35.22 
 
 
306 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2697  hypothetical protein  28.33 
 
 
378 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.644879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  22.94 
 
 
448 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1386  hypothetical protein  27.6 
 
 
402 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.82 
 
 
401 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  33.8 
 
 
407 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0113  hypothetical protein  23.16 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  33.67 
 
 
382 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  30.13 
 
 
426 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.12 
 
 
394 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>