67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2360 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  100 
 
 		 382 aa  784    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  30.7 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.88 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.88 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.71 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  26.39 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  24.21 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 689 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.49 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  25.32 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.63 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  23.92 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.72 
 
 		 381 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 690 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  24.24 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 690 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  26.7 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.16 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  21.8 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  23.32 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1625  hypothetical protein  24.29 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  25.82 
 
 		 550 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  21.16 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  22.92 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  28.98 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  26.97 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  22.6 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  24.52 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5003  hypothetical protein  22.9 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.403885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  20.66 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.87 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  27.49 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  22.29 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  20.38 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  24.32 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  25.29 
 
 		 331 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.61 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  24.85 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.47 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.14 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.67 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  22.8 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.14 
 
 		 376 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.67 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  22.4 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  26.35 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  21.58 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  20.89 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  25.13 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  26.24 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  23.39 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  24.75 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  20.72 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  23.48 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  20.94 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1499  hypothetical protein  34.07 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.488999  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2686  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 		 567 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0893187  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1858  hypothetical protein  23.03 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0114  hypothetical protein  25.89 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  19.47 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  22.54 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  27.17 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.19 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>