42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2282 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  817    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  32.89 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.04 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  31.54 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  31.33 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  31.11 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  31.1 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  31.3 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.36 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  28.72 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  30.75 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  29.64 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  29.82 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  26.84 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.02 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  31.95 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  31.73 
 
 		 398 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.2 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  27.4 
 
 		 408 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  25.26 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  27.81 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  24.02 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  24.92 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  23.08 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  24.86 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.76 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  24 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.13 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.26 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.27 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  23.69 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  25.79 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.31 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  21.88 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3241  hypothetical protein  22.41 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 690 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 690 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.84 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.84 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 689 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  23.7 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.03 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>