28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1636 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  100 
 
 
397 aa  783    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  88.64 
 
 
400 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  87.88 
 
 
400 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  58.19 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  57.72 
 
 
394 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  56.6 
 
 
398 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  35.4 
 
 
400 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  36.88 
 
 
400 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  36.69 
 
 
399 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  33.6 
 
 
395 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  33.51 
 
 
406 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.71 
 
 
397 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  34.22 
 
 
397 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  29.72 
 
 
416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  29.97 
 
 
404 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  27.91 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  28.8 
 
 
373 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  27.85 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  32.2 
 
 
406 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  29.66 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.9 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.73 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  26.04 
 
 
400 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  29.19 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  25.44 
 
 
359 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.42 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  23.36 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  23.77 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.532138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>