33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1603 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  100 
 
 		 400 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  88.64 
 
 		 397 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  98.75 
 
 		 400 aa  773    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  59.19 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  57.86 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  55.73 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  35.94 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  35.25 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  35.59 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  33.86 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  33.75 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  36.83 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  34.29 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  28.61 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  29.82 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  28.68 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  29.26 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  28.5 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  32.2 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  28.65 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.57 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.39 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  25.39 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  25.71 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  21 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.59 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  27.94 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  23.82 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  24.92 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  29.61 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  23.85 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.32 
 
 		 298 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.1 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>