42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2749 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  81.79 
 
 		 380 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  68.53 
 
 		 377 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  29.38 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  28.9 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.62 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.27 
 
 		 421 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  27.36 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  27.55 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  27.02 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  25.89 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  24.92 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  25.37 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  25.77 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.43 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  26.91 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  25.3 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  21.71 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.93 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  25.16 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  25.66 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  25.81 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  22.46 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  27.37 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  24.68 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  25.17 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  22.8 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  29.71 
 
 		 550 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  28.49 
 
 		 550 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 689 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  26.4 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.51 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  23.33 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01201  hypothetical protein  21.8 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.640897  normal  0.481871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1187  hypothetical protein  24.14 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1556  cellulose biosynthesis protein CelD  24.85 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  23.15 
 
 		 416 aa  46.2  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  22.9 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  24.55 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0350  hypothetical protein  25.97 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  26.15 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>