41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1416 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  815    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  79.49 
 
 
397 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  66.31 
 
 
400 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  61.87 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  66.05 
 
 
400 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  62.33 
 
 
397 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  62.4 
 
 
406 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  34.83 
 
 
434 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  33.75 
 
 
400 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  37.4 
 
 
398 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.7 
 
 
394 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  33.5 
 
 
400 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  33.6 
 
 
397 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  29.22 
 
 
437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  30.75 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  29.92 
 
 
416 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  26.53 
 
 
413 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  26.6 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  26.58 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  25.13 
 
 
373 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  28.12 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.72 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  24.85 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  25.67 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.36 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.66 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  21.27 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.18 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  21.99 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  24.15 
 
 
395 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  30.84 
 
 
372 aa  49.7  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  24.36 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 
689 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.98 
 
 
393 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.98 
 
 
393 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  22.89 
 
 
349 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.18 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  26.44 
 
 
550 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
358 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  33.68 
 
 
360 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.92 
 
 
392 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>