31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1158 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  802    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  34.47 
 
 
373 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  34.85 
 
 
416 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  31.14 
 
 
404 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  30 
 
 
413 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  29.15 
 
 
413 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  32.32 
 
 
400 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  29.87 
 
 
397 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  31.67 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  29.61 
 
 
397 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  28.43 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  29.05 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  29.29 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.98 
 
 
434 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  28.88 
 
 
394 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.34 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  26.05 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  26.5 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  27.07 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  31.22 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.99 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.92 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  29.8 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  26.13 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  29.24 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.26 
 
 
377 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  23.3 
 
 
380 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.14 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  27.56 
 
 
336 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  28.14 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
355 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>