65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2374 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  100 
 
 
359 aa  722    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  32.8 
 
 
391 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.51 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.81 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.15 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.59 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  28.57 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  28.28 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  28.57 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.85 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  29.8 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  29.8 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  30.23 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.06 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  30.14 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  33.33 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  28.08 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
311 aa  62.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  25.81 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  26.51 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.49 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  23.84 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  25.69 
 
 
425 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  28.07 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.57 
 
 
436 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  30.47 
 
 
386 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  27.22 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  32 
 
 
379 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  26.88 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  28.08 
 
 
385 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  28.68 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  27.06 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.41 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.84 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  30.57 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.41 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.63 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  29.94 
 
 
380 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  31.03 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  25 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  23.4 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  30.65 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  22.04 
 
 
386 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  26 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  23.57 
 
 
336 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
355 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  29.8 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.01 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.19 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  23.17 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  29.1 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  29.57 
 
 
385 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  22.01 
 
 
369 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  20 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  24.8 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  25.42 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  27.91 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  22.81 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  28.68 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  32.61 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  23.84 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  24.82 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  23.16 
 
 
448 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  31.18 
 
 
382 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>