61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1536 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  78.23 
 
 		 372 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  63.32 
 
 		 379 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  37.53 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  37.53 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.44 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  32.78 
 
 		 437 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  29.77 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  28.25 
 
 		 425 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  31.13 
 
 		 428 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  30.88 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  28.06 
 
 		 424 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  27.6 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  29.91 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  29.79 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  29.79 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  30.26 
 
 		 407 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  29.19 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  31.03 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  31.63 
 
 		 394 aa  89.4  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  24.01 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  34.52 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  30.58 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  31.25 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  30.7 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  29.67 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  37.21 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  34.72 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  27.3 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  33.52 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  34.27 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  24.92 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  34.97 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  34.07 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  28.87 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  34.42 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  37.9 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  37.9 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  28.47 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  37.1 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.61 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.52 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  31.78 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  26.5 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  23.97 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.57 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.14 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  30.59 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  27.42 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.85 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.61 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  25.9 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.87 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.8 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.84 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  28.42 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  26.43 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5438  hypothetical protein  29.52 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3543  hypothetical protein  31.51 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>