46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1718 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  755    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  81.61 
 
 		 385 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  68.15 
 
 		 386 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  56.64 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  53.67 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  56.25 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  44.58 
 
 		 396 aa  193  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  35.95 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  33.43 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  34.46 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  33.03 
 
 		 428 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  32.82 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  34.5 
 
 		 424 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  32.11 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  30.99 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  31.59 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  31.88 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  29.63 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.11 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  33.64 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  31.38 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  32.54 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  32.21 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  30.58 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  37.04 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  27.84 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  28.62 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  26.14 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  31.61 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  25.42 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  35.39 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  28.31 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.8 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  29.8 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  35.29 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.35 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.35 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  30 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  31.21 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.11 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.43 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  29.49 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.9 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  27.93 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>