60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0252 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  100 
 
 
396 aa  763    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  42.2 
 
 
411 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  45.51 
 
 
388 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  39.77 
 
 
407 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  38.24 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  43.53 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  40.56 
 
 
386 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  37.23 
 
 
426 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  34.84 
 
 
428 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  37.16 
 
 
428 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  37.16 
 
 
428 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  35.67 
 
 
427 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  34.62 
 
 
424 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  31.75 
 
 
425 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  31.48 
 
 
425 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  30.92 
 
 
430 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  35.34 
 
 
394 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  36.09 
 
 
387 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  29.55 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  33.05 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  33.05 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.96 
 
 
436 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  29.97 
 
 
372 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  34.07 
 
 
379 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  29.67 
 
 
378 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  30.91 
 
 
374 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  28.9 
 
 
411 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  29.2 
 
 
437 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  35.31 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  35.98 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  34.88 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  38.71 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  25.65 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  33.88 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  26.11 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  26.75 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35.66 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  27.75 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  33.68 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  40.35 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.6 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  40.35 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  26.61 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  39.47 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  36.46 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  27.31 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  30.08 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.48 
 
 
381 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0230  hypothetical protein  29.17 
 
 
311 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0237146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5438  hypothetical protein  30.5 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.88 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35.05 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  28.1 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.07 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.07 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.43 
 
 
392 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>