30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2339 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  673    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1931  hypothetical protein  44.51 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  44.5 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  31.34 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  33.17 
 
 		 370 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  38.98 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  26.95 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  26.5 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  34.51 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.67 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  29.27 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.15 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.25 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.63 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35.24 
 
 		 376 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.29 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.29 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  37.14 
 
 		 424 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  36.62 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  31.91 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.57 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35.37 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  24.85 
 
 		 448 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.19 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2413  cellulose biosynthesis protein CelD  24.68 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.92081  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  35.59 
 
 		 391 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  25.85 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  31.43 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  37.68 
 
 		 436 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>