55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2464 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  100 
 
 		 377 aa  773    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  50.94 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.33 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  24.73 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.77 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  23.92 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.06 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.61 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  23.34 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.82 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.15 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.61 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  26.39 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  27.69 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.85 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.42 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.14 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  21.1 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  25.22 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  24.84 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.93 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  30.65 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  27.71 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  26.14 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  27.5 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.36 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.69 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1388  hypothetical protein  22.62 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480209  normal  0.0990972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  26.7 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  25.73 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  24.64 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2669  hypothetical protein  26.14 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  26.85 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  24.38 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  24.83 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  26.69 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  21.05 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  24.18 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.37 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  21.63 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  26.19 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  26.57 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  23.85 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  24.48 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  25.12 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  27.97 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  23.7 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1625  hypothetical protein  23.3 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370324  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  23.7 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.27 
 
 		 298 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  37.5 
 
 		 360 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  27.39 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>