63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1568 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  744    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  37.2 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.85 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.86 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  34.4 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  34.53 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  34.78 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  25.25 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.58 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.58 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.58 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  32.48 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  32.48 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  30.5 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  34.31 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  32 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  32 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  29.46 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  24.32 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  24.83 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  32.82 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  29.92 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  30.65 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  30.33 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  27.2 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  30.07 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  21.26 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.29 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  27.12 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  25.88 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.28 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  31.3 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  31.85 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  28.4 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.57 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  30 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.33 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  28.68 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  25.45 
 
 		 437 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  25.97 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.47 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  32.74 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.47 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.46 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  28.03 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  28.46 
 
 		 407 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  30.6 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  29.82 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  30.28 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  23.3 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.49 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  26.5 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  33.58 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  28.03 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25 
 
 		 298 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  29.23 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  22.65 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  32 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  20.81 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  32.46 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  30.08 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>