53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2997 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  884    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  37.61 
 
 		 387 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  38.67 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  34.44 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  30.79 
 
 		 425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  32.02 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  30.42 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  30.42 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  28.34 
 
 		 424 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  28.79 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  28.92 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  28.31 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  30.94 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  30.94 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  31.56 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  30.92 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  30.42 
 
 		 411 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.33 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  29.74 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  32.33 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  30 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  29.91 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  29.63 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  28.35 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  28.35 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  29.27 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  27.72 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  26.06 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.39 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.39 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.39 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  25.74 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  35.07 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  27.2 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  24.17 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  27.03 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.23 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  25.95 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.8 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  25.24 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35.2 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  32.61 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  26.14 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  31.18 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  27.81 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  23.6 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  34.07 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  30 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.18 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.38 
 
 		 377 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  24.78 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  26.62 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  23.31 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>