51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2372 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  59.49 
 
 
380 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  58.36 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  58 
 
 
385 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  53.63 
 
 
382 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  53.05 
 
 
382 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  27.49 
 
 
428 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  29.17 
 
 
428 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  29.27 
 
 
424 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  31.32 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  28.66 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  26.69 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  43.17 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  36.42 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  28.78 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  25.62 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  32.33 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  30.92 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  28.02 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  25.26 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  32.16 
 
 
379 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.54 
 
 
436 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  32.93 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  36.93 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  36.93 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  28.35 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  35.98 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  42.28 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  28.14 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  41.32 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  30 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  43.48 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  28.88 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  26.63 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  26.42 
 
 
425 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  28.13 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  28.83 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  35.88 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  29.03 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.01 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  30.4 
 
 
391 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  27.46 
 
 
411 aa  56.2  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.84 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  31.01 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  23.45 
 
 
370 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.16 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  31.41 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  27.31 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  20.69 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>