55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0986 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  95.26 
 
 		 380 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  82.29 
 
 		 385 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  57.6 
 
 		 379 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  52 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  51.46 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  28.44 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  28.75 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  28.18 
 
 		 425 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  29.76 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  35.21 
 
 		 436 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  35.21 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  27.05 
 
 		 425 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  29.76 
 
 		 428 aa  89.4  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  29.76 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  26.59 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  33.95 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  35.37 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  34.64 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.97 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  27.32 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  34.88 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  30.81 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  41.8 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  25.95 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  40.98 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  31.43 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  41.32 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  29.66 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  25.33 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  29.15 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  28.3 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  25 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  35.29 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.91 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  29.73 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  29.73 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.56 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  27.27 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  35.59 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  32.11 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  27.91 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  28.18 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  34.25 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  26.32 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  31.3 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  27.78 
 
 		 437 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  31.79 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  23.27 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  29.48 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 689 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2413  cellulose biosynthesis protein CelD  28.16 
 
 		 359 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.92081  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  26.28 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>