22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1804 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  677    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  33.73 
 
 
358 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  30.12 
 
 
338 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  38.98 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  30.04 
 
 
370 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1931  hypothetical protein  36.21 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  26.73 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.93 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  20.15 
 
 
448 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2697  hypothetical protein  31.54 
 
 
378 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.644879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.1 
 
 
401 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.07 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.69 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.3 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  30.05 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.43 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  27.59 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  30 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35.42 
 
 
393 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2517  hypothetical protein  21.47 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2413  cellulose biosynthesis protein CelD  25.91 
 
 
359 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.92081  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  24.68 
 
 
332 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>