48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2017 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  762    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  28.61 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  23.47 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  29.03 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.73 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  26.95 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  21.1 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  32.72 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  28.28 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.78 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.47 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.68 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.65 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  23.35 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  25.65 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  22.16 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  27.18 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.85 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.85 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  33.77 
 
 		 382 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1931  hypothetical protein  25.21 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  33.77 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.85 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  25.34 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  25.15 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.91 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  23.91 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  22.67 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.08 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.39 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.84 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.01 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  18.99 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  22.67 
 
 		 451 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1386  hypothetical protein  25.67 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  23.53 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  21.47 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  22.22 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  26.44 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  20.34 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5003  hypothetical protein  21.41 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.403885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  25.88 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  21.92 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  23.94 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2413  cellulose biosynthesis protein CelD  24.27 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.92081  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  21.24 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>