54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0710 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  79.54 
 
 		 436 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  99.08 
 
 		 451 aa  866    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  100 
 
 		 436 aa  873    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  37.53 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  39 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  36.24 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  32.9 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  29.92 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  29.92 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  29.64 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  31.12 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  30.73 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  28.25 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  31.92 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  27.98 
 
 		 425 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  30.58 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  29.35 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  28.35 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  32.46 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  30.81 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  32.48 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  32.13 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  28.69 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  28.88 
 
 		 386 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  31.11 
 
 		 406 aa  96.7  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  29.79 
 
 		 374 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  27.15 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  27.93 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  26.98 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  37.27 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  36.76 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  36.25 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  35 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  30.53 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  39.68 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.8 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  35.58 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  37.29 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.82 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.94 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  28.03 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.31 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.14 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.41 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.14 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  24.78 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  30.22 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.43 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  24.52 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  22.67 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.32 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  26.27 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>