57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1918 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  50.88 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  38.67 
 
 		 430 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  35.11 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  33.05 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  36.33 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  32.15 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  31.86 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  30.97 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  31.25 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.43 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  36.01 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  32.08 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  35.34 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  29.35 
 
 		 436 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  29.35 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  33.53 
 
 		 374 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  31.86 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  28.12 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  29.64 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  32.6 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  31.38 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  28.98 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  39.05 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  29.7 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  37.76 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  31.63 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  26.61 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  34.02 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  26.13 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  32.29 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  39.06 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  28.35 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  28 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.97 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  32.34 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.81 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.24 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  27.32 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  30.53 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  24.91 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  28.72 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  32.91 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  25.15 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.43 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  27.33 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.82 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.3 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  25.53 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  27.27 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  25 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2669  hypothetical protein  31.37 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  22.78 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  31.75 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.37 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>