20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5074 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  782    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.95 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.66 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.39 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.86 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  21.41 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.64 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  25.69 
 
 
386 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  22.79 
 
 
391 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  25.32 
 
 
363 aa  49.7  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  27.73 
 
 
374 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  25.25 
 
 
359 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  21.83 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  23.31 
 
 
430 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  22.78 
 
 
394 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  29.32 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  23.94 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  28.26 
 
 
382 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0113  hypothetical protein  26.32 
 
 
349 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.79 
 
 
377 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>