64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2693 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  805    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.8 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.2 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.36 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.66 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.05 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  26.85 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  28.34 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  34.13 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  29.78 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  27.71 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  26.79 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  34.09 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  28.12 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  32.69 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  27.81 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  29.82 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  29.82 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  31.62 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  24.28 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  28.49 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  28.14 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  26.05 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  30.47 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  26.9 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  27.91 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  26.9 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  30.4 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  21.49 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  28.41 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  30.71 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  28.03 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  28.44 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  32.87 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  30.77 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  22.55 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  30.4 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  26.23 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  28 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  29.7 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  25.15 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  26.94 
 
 		 550 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  21.29 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  22.7 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.7 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  28.68 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  20.57 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  25 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  32.03 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.83 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  22.4 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  23 
 
 		 550 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.01 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.63 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  18.37 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.63 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  25.88 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  23.55 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  26.42 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  27.73 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  21.92 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  31.07 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  25.24 
 
 		 385 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>