57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5558 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  726    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  74.57 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  55.18 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  51.2 
 
 		 380 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  51.24 
 
 		 380 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  52.66 
 
 		 385 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  32.68 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.4 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  33.47 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  33.47 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  33.47 
 
 		 451 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  35.94 
 
 		 372 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  35.08 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  30.67 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  26.72 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  45.53 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  29.39 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  26.29 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  30.82 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  31.18 
 
 		 430 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  29.67 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  29.57 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  40.15 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  34.91 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  38.93 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  28.32 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  28.32 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  34.01 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  37.72 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  29.79 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  43.48 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  43.48 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  24.68 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  31.05 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  42.61 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  32.64 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  37.01 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  30.77 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  27.08 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  37.01 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  25.17 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.57 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  27.01 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  30.59 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  30.83 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  29.94 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  29.05 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.95 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  22.65 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.87 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  28.77 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  32.67 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  29.61 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  26.62 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.16 
 
 		 392 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.99 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>