51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3070 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  100 
 
 		 386 aa  789    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.55 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  31.03 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.36 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  28.11 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  28.95 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  28.5 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  28.11 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.23 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  30.53 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  30.53 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  30.26 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.23 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  31.61 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.23 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  29.19 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  29.41 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  23.83 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  26.19 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  26.19 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  23.87 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  24.54 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  32.56 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  36.52 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  25.24 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  28.02 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  36.89 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.31 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  36.63 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  34.21 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  35.65 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  32.37 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  26.88 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  27.64 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  24.91 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  23.97 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  27.86 
 
 		 359 aa  53.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  28.91 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.04 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  25.69 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  20.61 
 
 		 338 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  27.78 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  30.58 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  20.65 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  18.99 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2720  hypothetical protein  24.22 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000405444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  27.27 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  23.81 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  35 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0831  hypothetical protein  24.87 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000238095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>