56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5467 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  820    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  63.47 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  61.76 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  56.25 
 
 		 388 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  57.26 
 
 		 385 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  56.3 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  42.2 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  31.65 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  31.62 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  32.22 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  29.29 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  29.29 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  29.01 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  30.42 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  31.08 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  31.08 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  32.73 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  32.08 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  30.58 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  28.46 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  30.58 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  34.08 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  32.42 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.18 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  27.93 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  29.19 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  29.01 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  31.65 
 
 		 411 aa  94  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  33.07 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  26.28 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  30.26 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  31.39 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  32.52 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.08 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  28.35 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.68 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.19 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.68 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  28.46 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.89 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  31.63 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.01 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.64 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  30.23 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  22.38 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.98 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  27.52 
 
 		 359 aa  47  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  34.75 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.24 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.46 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.46 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.46 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  30.81 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3792  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)  30.43 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  28.26 
 
 		 338 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  28.12 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>