55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3833 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  95.53 
 
 
425 aa  845    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  65.38 
 
 
424 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  63.7 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  49.08 
 
 
428 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  49.48 
 
 
428 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  49.34 
 
 
428 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  48.14 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  27.98 
 
 
451 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  27.98 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  28.92 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.01 
 
 
436 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  31.48 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  30.92 
 
 
379 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  31.08 
 
 
411 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  32.11 
 
 
388 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  27.62 
 
 
387 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  29.46 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  27.6 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  27.68 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  28.45 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  35.29 
 
 
372 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  27.33 
 
 
425 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  31.86 
 
 
394 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  27.68 
 
 
406 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  28.92 
 
 
374 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  31.2 
 
 
386 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  28.18 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  27.88 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  25.68 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  28.06 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  25.62 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  29.49 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  24.79 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  27.78 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  23.83 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  39.13 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.04 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.04 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.5 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
355 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  26.83 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  29.29 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  26.56 
 
 
370 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.25 
 
 
392 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.89 
 
 
393 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.89 
 
 
393 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.91 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  28.26 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  28.26 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.08 
 
 
368 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  22.77 
 
 
338 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
358 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>