52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1066 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  777    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  50.88 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  37.61 
 
 
430 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  37.65 
 
 
425 aa  195  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  31.58 
 
 
427 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  33.24 
 
 
426 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  31.9 
 
 
424 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  29.7 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  29.97 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  29.66 
 
 
428 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  28.06 
 
 
425 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  28.06 
 
 
425 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  36.09 
 
 
396 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  33.88 
 
 
411 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  33.23 
 
 
407 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  34.65 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  32.54 
 
 
388 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  34.25 
 
 
385 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  30 
 
 
386 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  28.69 
 
 
436 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  28.69 
 
 
451 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.91 
 
 
436 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  43.18 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  30.88 
 
 
437 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  34.52 
 
 
379 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  28.44 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  27.34 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  29.5 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  26.55 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  26.88 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  42.48 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  42.98 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  42.11 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  36.36 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  24.54 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  30.26 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  25.09 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  30.41 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.3 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  35.43 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  24.67 
 
 
370 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  28.29 
 
 
386 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  27.6 
 
 
359 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.76 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  26.92 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  24.46 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  30.6 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
355 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  24.46 
 
 
395 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>