45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1783 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  100 
 
 		 376 aa  759    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  50.94 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  24.6 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  23.47 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.41 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.28 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.99 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.12 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.61 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.75 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.46 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.3 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.25 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  23.32 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  27.83 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  27.27 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.49 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  21.18 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  25.22 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  24.61 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  34.07 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  25.32 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  27.35 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.78 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  29.28 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1388  hypothetical protein  22.6 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480209  normal  0.0990972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  24.03 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  24.73 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.71 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  29.55 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 689 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  23.41 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  26.07 
 
 		 448 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  32.43 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2669  hypothetical protein  28.1 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  25.17 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  23.15 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5313  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.33 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  24.82 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  22.77 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  31.53 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  20.45 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  30 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  30.84 
 
 		 380 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>