30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3221 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  807    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.39 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  24.78 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  25.21 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  23.34 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.41 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.64 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  25.22 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1388  hypothetical protein  23.42 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480209  normal  0.0990972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  23.66 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  19.66 
 
 		 298 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  27.33 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  24.72 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  17.8 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  23.43 
 
 		 550 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.56 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  28.66 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.1 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  25.55 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2313  protein of unknown function DUF482  27.12 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1950  hypothetical protein  24.62 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0965898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  25.38 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  23.45 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  36.84 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.06 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.94 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  27.27 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  24.08 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  23.04 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>