39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3148 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  100 
 
 		 377 aa  764    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  68.53 
 
 		 380 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  67.02 
 
 		 380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  27.86 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.26 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  27.02 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.27 
 
 		 421 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  27.27 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  27.69 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  26.99 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  24.26 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  25.66 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  25.86 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  27.48 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  26.02 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  24.7 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  24.93 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  27.97 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  24.78 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0159  hypothetical protein  20.19 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  24.62 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  24.52 
 
 		 325 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  26.28 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  23.03 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  19.05 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  27.17 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  24.43 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  22.15 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  22.85 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  26.92 
 
 		 360 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  26.67 
 
 		 550 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  25.41 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1757  hypothetical protein  24.9 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.857933  hitchhiker  0.00701544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  23.37 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1388  hypothetical protein  26.09 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480209  normal  0.0990972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  22.64 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.39 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  25.79 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>