36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5867 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  100 
 
 
434 aa  839    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  72.51 
 
 
398 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  58.19 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  57.86 
 
 
400 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  58.1 
 
 
400 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  55.18 
 
 
394 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  36.48 
 
 
400 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  37.57 
 
 
397 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  36.29 
 
 
400 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  35.2 
 
 
397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  34.83 
 
 
395 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  36.39 
 
 
399 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  37.17 
 
 
406 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  31.43 
 
 
413 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  29.56 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  30.4 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  29.77 
 
 
413 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  30.79 
 
 
373 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  32.36 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.22 
 
 
375 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  27.3 
 
 
437 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.35 
 
 
421 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  31.65 
 
 
400 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  26.03 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  29.38 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  25.31 
 
 
380 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  25.23 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  28.88 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  22.74 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  20.98 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.77 
 
 
368 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1386  hypothetical protein  29.74 
 
 
402 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.97 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  29.29 
 
 
326 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  23.83 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  28.66 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>