37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2662 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  814    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  82.75 
 
 		 400 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  70.25 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  64.25 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  66.05 
 
 		 395 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  62.75 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  62.91 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  36.29 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  35.25 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  32.91 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  36.48 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1884  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  35 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  35.11 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  31.41 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1667  hypothetical protein  28.04 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1226  hypothetical protein  26.12 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0671994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  30.08 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  29.52 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  27.75 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  26.05 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.32 
 
 		 375 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  27.11 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1158  hypothetical protein  30.35 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.46 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  26.22 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  24.53 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.8 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  23.9 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  35.9 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  28.19 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  24.59 
 
 		 349 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.93 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  25.48 
 
 		 550 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  29.37 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.77 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.43 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  34.07 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>