25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6855 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  100 
 
 		 354 aa  736    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  94.63 
 
 		 468 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07781  cellulose biosynthesis protein CelD  23.88 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0132299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  23.53 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.76 
 
 		 394 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  27.33 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.24 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.3 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  22.38 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  24.43 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.35 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  25.71 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.82 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  30.39 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1314  hypothetical protein  23.53 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  26.27 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  28.39 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  22.7 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  27.89 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  26.9 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  20.29 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.61 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  24.28 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0855  hypothetical protein  26.16 
 
 		 416 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  0.24212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  27.43 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>