74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2018 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  100 
 
 		 370 aa  770    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  28.61 
 
 		 369 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  32.02 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  31.73 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3126  hypothetical protein  29.88 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.764656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  24.6 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  32.34 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  26.39 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1931  hypothetical protein  29.06 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 		 689 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  23.34 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  25.15 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.21 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.72 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.18 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2413  cellulose biosynthesis protein CelD  29.75 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.92081  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.88 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  25.09 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.34 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.3 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.34 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  26.04 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.84 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  23.86 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  23.6 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.56 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  26.13 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  27.71 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  24.06 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  28.84 
 
 		 550 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3442  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.9 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  26.46 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  27.78 
 
 		 424 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  26.56 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  21.41 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  26.56 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  27.65 
 
 		 550 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  24.58 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  29.17 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  25.32 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.22 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  26.47 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  21.61 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  26.47 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  25.9 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  25.45 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  20.65 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  28.21 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  28.33 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  22.73 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  20.85 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2686  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 		 567 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0893187  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  25 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  22.38 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  25.09 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  24.87 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.92 
 
 		 368 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.4 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  26.18 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  23.45 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0964  TPR and WD-40 repeat-containing protein  22.39 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1074  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 690 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  21.26 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  23.19 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.86 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1077  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 		 690 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.383593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  23.04 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  27.54 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.28 
 
 		 354 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.3 
 
 		 436 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>