53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1273 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  804    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  79.17 
 
 
407 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  63.47 
 
 
411 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  53.67 
 
 
388 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  54.91 
 
 
385 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  55.46 
 
 
386 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  37.43 
 
 
396 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  33.72 
 
 
427 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  34.47 
 
 
424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  30.94 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  31.74 
 
 
426 aa  133  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  36.01 
 
 
394 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  31.32 
 
 
425 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  31.55 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  29.5 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  30.26 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  27.68 
 
 
425 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  29.11 
 
 
425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  34.65 
 
 
387 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  31.11 
 
 
436 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  31.11 
 
 
451 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  34.35 
 
 
379 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  31.03 
 
 
378 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.14 
 
 
436 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  31.99 
 
 
372 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  31.52 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  26.39 
 
 
437 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  26.81 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  29.19 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  25.14 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  32.29 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.82 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  35.06 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  24.06 
 
 
370 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.38 
 
 
368 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  28.83 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  28.02 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.45 
 
 
376 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  27.42 
 
 
391 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 
376 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  32.21 
 
 
385 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  35.51 
 
 
376 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.5 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  25.9 
 
 
363 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.96 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.27 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  36.44 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.27 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.27 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  31.62 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>