53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1947 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  874    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  85.98 
 
 		 428 aa  772    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  99.53 
 
 		 428 aa  870    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  55.93 
 
 		 426 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  53.11 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  53.46 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  49.87 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  49.08 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  30.42 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  30 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  29.92 
 
 		 436 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  35.05 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.61 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  30.31 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  32.82 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  29.29 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  31.86 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  30.56 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  29.66 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  29.63 
 
 		 407 aa  123  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  31.4 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  30.26 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  29.79 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  30.42 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  27.76 
 
 		 425 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  35.64 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  25.81 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  28.82 
 
 		 380 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  27.94 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  28.21 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  28.91 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  24.65 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  34.81 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.54 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.57 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  31.18 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  23.68 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  26.19 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  39.29 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  37.29 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.44 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  31.52 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  31.43 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  36.36 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  30 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  26.47 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5438  hypothetical protein  26.37 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  23.7 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.68 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.68 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.91 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1016  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 		 689 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>