55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3542 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  95.53 
 
 
425 aa  845    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  63.94 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  65.12 
 
 
424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  50.13 
 
 
428 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  49.87 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  49.74 
 
 
428 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  48.36 
 
 
426 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  28.25 
 
 
451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  28.25 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  32.06 
 
 
379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  28.31 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.73 
 
 
436 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  31.2 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  31.08 
 
 
411 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  27.62 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  28.25 
 
 
378 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  28.68 
 
 
437 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  30.99 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  28.07 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  27.63 
 
 
425 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  27.89 
 
 
385 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  31.42 
 
 
394 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  29.11 
 
 
406 aa  106  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  31.38 
 
 
386 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  28.83 
 
 
374 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  26.75 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  27.05 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  24.08 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  25.35 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  27.16 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  26.9 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  24.91 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  27.78 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  29.78 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  23.87 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  39.13 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.04 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.04 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.71 
 
 
378 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  26.83 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  30 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  26.56 
 
 
370 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  29.29 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.88 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.03 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.03 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  28.26 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  28.26 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.68 
 
 
359 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  21.31 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  22.32 
 
 
338 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0961  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
358 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>