61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3454 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  750    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  62.13 
 
 		 378 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  60.92 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  39 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  39 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  37.95 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  32.06 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  30.08 
 
 		 428 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  31.95 
 
 		 437 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  32.29 
 
 		 426 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  30.92 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  31.22 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  31.22 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  32.32 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  29.2 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  31.44 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  31.91 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  34.53 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  33.08 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  28.98 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  33.86 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  27.27 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  33.64 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  28.49 
 
 		 411 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  34.04 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  33.05 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  34.35 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  35.52 
 
 		 382 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  36.84 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  32.41 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  34.73 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  33.56 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.64 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  37.72 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  36.75 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.02 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  38.02 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  31.65 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  29.41 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  39.5 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  35.34 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  24.52 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  25.22 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  23.51 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  30.83 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.2 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  29.17 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.75 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  24.39 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  29.9 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  25.34 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  23.15 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1797  hypothetical protein  29.41 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 		 393 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.79 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  24.8 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  29.32 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  25.85 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>