57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2521 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  857    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  71.02 
 
 		 427 aa  584  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  65.38 
 
 		 425 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  65.12 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  53.35 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  55.31 
 
 		 428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  53.11 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  56.49 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  31.65 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  28.34 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  34.62 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  31.41 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  35 
 
 		 407 aa  136  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  34.5 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  31.92 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  31.37 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  32.05 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  34.47 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.79 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  31.61 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  37.24 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  31.84 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  28.06 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  27.38 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  29.64 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  31.94 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  28.17 
 
 		 374 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  28.65 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  29.27 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  28.37 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  29.73 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  32.22 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  31.06 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  34.62 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.05 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.33 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  34.82 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  23.69 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  35 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  33.93 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  27.45 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  26.88 
 
 		 386 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 355 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  30.06 
 
 		 382 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.37 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  27.78 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.58 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.58 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26 
 
 		 359 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  30.43 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  27.88 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0345  hypothetical protein  25.11 
 
 		 338 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.301298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  29.29 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  37.14 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  25.12 
 
 		 377 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5314  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 389 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>