53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5326 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  72.58 
 
 
382 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  52.15 
 
 
379 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  53.09 
 
 
380 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  52.47 
 
 
380 aa  240  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  52.8 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  36.23 
 
 
379 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  36.36 
 
 
436 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  34.36 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  35.93 
 
 
451 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  35.93 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  35.96 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  31.94 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  32.17 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  30.84 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  31.94 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  35.39 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  30.04 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  27.08 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  29.39 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  33.88 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  41.46 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  28.2 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  31.18 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  26.07 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  31.18 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  26.07 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  25.62 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  33.73 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  33.16 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  31.58 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  31.54 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  35.88 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  42.86 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  42.86 
 
 
376 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  43.75 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  23.68 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  32.04 
 
 
388 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  29.09 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.78 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  27.08 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  30.51 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.38 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  37.78 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  28.8 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.94 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.34 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  30.6 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  26.94 
 
 
437 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  23.23 
 
 
370 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  26.76 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  26.28 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  29.87 
 
 
346 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>