50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3755 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3755  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1718  hypothetical protein  81.61 
 
 		 388 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  64.1 
 
 		 386 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1521  hypothetical protein  60 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1273  hypothetical protein  54.91 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.202328  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5467  hypothetical protein  57.26 
 
 		 411 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0252  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase  42.94 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64776  normal  0.788486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3019  hypothetical protein  32.72 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  31.69 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1873  hypothetical protein  31.17 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1947  hypothetical protein  31.17 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.923183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  31.9 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1019  hypothetical protein  30.06 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.495508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  33.14 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  28.45 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  32.46 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  32.17 
 
 		 451 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  27.89 
 
 		 425 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.41 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  32.6 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  34.04 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  34.25 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  30.83 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  31.29 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  29.89 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  33.33 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1843  hypothetical protein  26.75 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1179  cellulose biosynthesis protein CelD  29.78 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.60809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  27.49 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1867  hypothetical protein  25 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4625  hypothetical protein  32.75 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.08 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  31.82 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  29.19 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.86 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  35.9 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  24.84 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  28.49 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  29.76 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  26.19 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.34 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.34 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  29.07 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.66 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.27 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  28.83 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  24.24 
 
 		 550 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1568  hypothetical protein  31.37 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  25.3 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5558  hypothetical protein  38.04 
 
 		 382 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>