43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2373 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  100 
 
 		 381 aa  773    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  25.33 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  27.41 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.22 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  29 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  23.72 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.16 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.16 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  23.78 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  32.99 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  23.26 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  28.8 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2669  hypothetical protein  30.41 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  31.45 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3070  cellulose biosynthesis protein CelD  25.31 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.65 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5312  hypothetical protein  31.91 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  29.31 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  28.18 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1066  hypothetical protein  25 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5326  hypothetical protein  29.5 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  0.0831536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0949  hypothetical protein  31.03 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  30.41 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  30.41 
 
 		 436 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  27.57 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.05 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5074  hypothetical protein  24.64 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0986  hypothetical protein  30.17 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4388  hypothetical protein  26.09 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  20.22 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2372  hypothetical protein  28.07 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000887607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1918  hypothetical protein  25.43 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.618119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5588  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.32 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.01 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  26.51 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  26.25 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  26.15 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  22.79 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1961  hypothetical protein  29.48 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.39 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0925  hypothetical protein  26.67 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0993  transcriptional regulator NifA  29.63 
 
 		 600 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>