18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3881 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3881  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  932    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2697  hypothetical protein  32.43 
 
 
378 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.644879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2539  hypothetical protein  31.1 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2517  hypothetical protein  27.98 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.770252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0114  hypothetical protein  28.04 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1386  hypothetical protein  29.81 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2913  hypothetical protein  25.77 
 
 
312 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1499  hypothetical protein  22.94 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.488999  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0113  hypothetical protein  28.44 
 
 
349 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1783  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  26.07 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.594262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  26.62 
 
 
430 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1804  hypothetical protein  21.19 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.25 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  23.85 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.11 
 
 
378 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2339  hypothetical protein  24.85 
 
 
334 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  32.63 
 
 
336 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.16 
 
 
359 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>